Научные лаборатории института:

Инженерная геодинамика.  Зав. лаб. – Минченко Вячеслав Дмитриевич

Ресурсы и мониторинг подземных вод. Зав. лаб. – Мавлонов Аслан Акрамович

Геоэкология и охран аподземных вод.  Зав. лаб. – Карпизина Галина Ивановна

Методические лаборатории института:

Гидрогеология и инженерная геология месторождений твердых полезных ископаемых. Зав. лаб. –  Закиров Мансур

Гидрогеофизика. Зав. лаб. – Абдуллаев Шавкат Хадияевич

Технологические лаборатории института:

Урана и гидроминеральных ресурсов. Зав. лаб. – Бакиев Саиднасым Алимович

Гидрохимическая лаборатория.  Зав. лаб. – Ходжаев Вахид Ганиевич

Центр мониторинга и кадастра подземных вод.  Нач. центра. – Мавлянов Темур Эркинович

Отдел научно- технической информации.   Зав. отд. – Кремлева Карина Александревна